Struktur kurikulum SMA Negeri 1 Mojolaban meliputi substansi pembelajaran yang ditempuh dalam satu jenjang pendidikan selama tiga tahun mulai Kelas X sampai dengan Kelas XII.
Sruktur kurikulum disusun berdasarkan standar kompetensi lulusan dan standar kompetensi mata pelajaran. Pengorganisasian kelas-kelas pada SMA Negeri 1 Mojolaban dibagi kedalam dua kelompok, yaitu kelas X merupakan program umum yang diikuti oleh seluruh peserta didik, dan kelas XI dan XII merupakan program penjurusan. SMA Negeri 1 Mojolaban membuka 2 pilihan yang terdiri atas 2 program yaitu :
1. Program Ilmu Pengetahuan Alam ( IPA ).
2. Program Ilmu Pengetahuan Sosial ( IPS ).
Kelas X terdiri atas 16 mata pelajaran, muatan lokal dan pengembangan diri. Muatan lokal merupakan kegiatan kurikuler untuk mengembangkan kompetensi yang disesuaikan dengan ciri khas daerah sehingga diharapkan dapat meningkatkan pencapaian kompetensi, termasuk keunggulan daerah, yang materinya tidak dapat dikelompokkan ke dalam mata pelajaran yang ada. Salah satu muatan lokal di SMA Negeri 1 Mojolaban adalah Bahasa Daerah.